Kommunen är en politiskt styrd organisation, det vill säga förtroendevalda ledamöter i kommunfullmäktige, kommunstyrelse och nämnder beslutar om kommunens verksamheter.
Den politiska ledningen i Nykvarns kommun för mandatperioden 2007-2010 består av Nykvarnspartiet, Moderata samlingspartiet och Centerpartiet. De har majoritet i kommunfullmäktige - 19 av 31 mandat.